Kdy nesmí být magnetoterapie používána

• V těhotenství. Přesto, že nejsou známy zprávy o negativním působení magnetických polí, je nutná předběžná opatrnost.
• Při používání citlivých lékařských elektronických zařízení jako jsou kardiostimulátor, podpůrné sluchové zařízení, apod.
• Při krvácení jakéhokoli původu.
• Při akutní tuberkulóze.
• U osob s diagnózou tumoru a po operaci zhoubného nádoru nebo léčbě chemoterapií (dle zvážení lékaře).
• U žádné infekční či mykotické (plísňové) choroby.
• Při záchvatovitých neurologických onemocněních jako je epilepsie, apod.
• U bolestí neznámého původu v krajině břišní.
• Při hematologických onemocněních (onemocnění krve).
• Při extrémně nízkém krevním tlaku (hypotenzi).
• Dva dny před a dva dny po menstruaci (individuální). Aplikujeme-li však magnetoterapii mimo zmíněné období, jsou bolesti během menstruace mírnější. V době menstruace samozřejmě je možno aplikovat mimo bederní oblast.
• Nedoporučuje se kombinace s léčbou steroidy a elektroléčbou. Naopak, kombinace se světloléčbou je indikována a ideální je v kombinaci s laserem.

Velice důležité je, aby v průběhu léčby pulsním magnetickým polem nebyla prováděna žádná rentgenová vyšetření nebo léčba ozařováním (mimo laserovou terapii). Tyto vyšetřovací metody negativně působí na dosažené výsledky terapie. Regenerační procesy, které byly nastartovány, tím bývají přerušeny. Po delším ozařování rentgenovými nebo jinými paprsky je magnetoterapie méně účinná. Může však být velice úspěšně nasazena v rámci doléčení.